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Relación entre tipo de alojamiento y flora intestinal

El análisis de más de 3.000 secuencias de ARNr 16S de lechones alojados en tres ambientes diferentes, outdoor, indoor o en boxes aislados con antibióticos diarios, reveló diferencias en la microflora del íleon de los cerdos adultos. Estas diferencias se atribuyeron a los diferentes ambientes a los que fueron expuestos al principio de su vida. Las muestras ileales y fecales se tomaron el día 56 del experimento y se complementaron con muestras fecales de cerdas adultas indoor y outdoor para confirmar que el entorno era la principal causa de las diferencias experimentales.

7 enero 2010
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El análisis de más de 3.000 secuencias de ARNr 16S de lechones alojados en tres ambientes diferentes, outdoor, indoor o en boxes aislados con antibióticos diarios, reveló diferencias en la microflora del íleon de los cerdos adultos. Estas diferencias se atribuyeron a los diferentes ambientes a los que fueron expuestos al principio de su vida. Las muestras ileales y fecales se tomaron el día 56 del experimento y se complementaron con muestras fecales de cerdas adultas indoor y outdoor para confirmar que el entorno era la principal causa de las diferencias experimentales.

Distribución filogenética de los clones obtenidos a partir de muestras ileales y fecales según los distintos ambientes

Gráfico 1.- La mayoría de los clones fueron asignados al filo Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, y Actinobacteria. El filo Firmicutes fue significativamente más elevado en el grupo outdoor (OUT) en comparación con el grupo alojado en boxes individuales (IR). El filo Bacteroides fue significativamente mayor en las muestras fecales de cerdas adultas indoor (INS) y outdoor (OUTS) en comparación con las ileales.

Presencia de lactobacilos en muestras ileales y fecales según los distintos ambientes

La familia Lactobacillaceae incluye L. reuteri, L. amylovorous LAB31, L. johnsonii, L. delbrueckii subsp. bulgaricus, L. salivarius y L. mucosas.
L. reuteri, L. delbrueckii y L. johnsonii estuvieron menos presentes en los animales indoor (IN) y en los alojados en boxes individuales con antibióticos (IR) en comparación con el grupo outdoor (OUT).

Los cerdos alojados al aire libre mostraron un predominio de Firmicutes, en particular Lactobacillus, mientras que los animales alojados en una instalación con mayor higiene presentaron menos Lactobacillus y mayor número de filotipos potencialmente patógenos.

El estudio reveló una fuerte correlación negativa entre la abundancia de Firmicutes y las poblaciones de bacterias patógenas en el intestino, sobretodo en los animales alojados en los boxes individuales con antibióticos. Los animales criados en interior mostraron una mayor expresión de interferón Tipo 1, Complejo mayor de histocompatibilidad y varias citoquinas.

El ambiente de las primeras etapas afecta significativamente tanto en la composición microbiana de la mucosa intestinal de la vida adulta como la inmunología.

IE Mulder, et al. Environmentally-acquired bacteria influence microbial diversity and natural innate immune responses at gut surfaces. BMC Biology 2009, 7:79

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