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La genómica como clave para descifrar la circulación del virus de la PPA

A pesar de décadas de investigación, el genoma del virus de la peste porcina africana sigue siendo un gigante complejo y difícil de descifrar. El Centro de Referencia Nacional de PPA (CEREP) del IZSUM utiliza la genómica para estudiar la circulación del virus en Italia y otros países.

Estudiar el genoma del virus de la peste porcina africana (PPA) es como intentar leer un manuscrito de miles de páginas, escrito en un idioma desconocido y sobre el que aún existe información incompleta. Este patógeno, responsable de una enfermedad vírica devastadora que afecta tanto a cerdos domésticos como a jabalíes, representa actualmente una de las mayores amenazas para la producción porcina mundial. Sin embargo, a pesar de décadas de investigación, su genoma está lejos de haberse descifrado por completo.

Un virus “excepcional”

El primer obstáculo para su estudio es el tamaño y la complejidad de su genoma. Con un tamaño que oscila entre 170 y 193 kilobases, el virus de la PPA posee el genoma más extenso conocido entre los virus de ADN que infectan animales. Contiene más de 150 genes, muchos de los cuales tienen funciones aún desconocidas o difíciles de interpretar.

A modo de comparación, el virus de la gripe —mucho más estudiado— tiene solo ocho segmentos genómicos y poco más de una docena de proteínas.

Esta enorme complejidad genética no es solo una curiosidad biológica: representa un verdadero desafío tecnológico. Las regiones repetidas, los genes duplicados y las variaciones estructurales dificultan una secuenciación completa y precisa.

Pocas secuencias, muchas incógnitas

Para complicar aún más la situación, se suma una escasez de genomas completos compartidos en bases de datos internacionales. A pesar de la propagación global del virus, solo se dispone de un número limitado de secuencias. Esto limita la capacidad de comparar cepas, comprender su evolución e identificar mutaciones clave relacionadas con la virulencia o la transmisibilidad.

Las causas de esta escasez son principalmente técnicas y logísticas, pero también existe una falta de concienciación colaborativa entre países. La manipulación del virus de la PPA requiere laboratorios de alta seguridad (BSL-3), y solo unos pocos centros están equipados para realizar análisis genómicos completos. Además, la secuenciación de un genoma de este tamaño supone costes y tiempos significativamente superiores a los de otros virus.

El caso de Italia: Un laboratorio natural

Un aporte fundamental a nuestro conocimiento del virus de la PPA ha venido recientemente de Italia. El estudio “Caracterización molecular de las primeras cepas de genotipo II del virus de la peste porcina africana identificadas en la Italia peninsular” (Giammarioli et al., 2023) proporcionó la primera caracterización molecular de cepas de genotipo II identificadas en la península, revelando su estrecha relación con las cepas extendidas en Europa del Este.

Figura 1. Ruta probable del virus de la PPA hacia las agrupaciones en Lacio, Campania y Renania del Norte-Westfalia
Figura 1. Ruta probable del virus de la PPA hacia las agrupaciones en Lacio, Campania y Renania del Norte-Westfalia

Posteriormente, otro estudio publicado en 2025, “Un enfoque genómico amplio identifica una deleción natural de fragmentos grandes en cepas del virus de la PPA circulantes en Italia durante 2023” (Torresi et al., 2025), identificó grandes deleciones naturales en determinadas cepas víricas. Estas mutaciones, que implican la pérdida de porciones enteras del genoma, podrían influir en la virulencia o la capacidad del virus para evadir la respuesta inmunitaria, aunque aún debe esclarecerse su importancia biológica.

Genotipos, serotipos y propagación global

El virus de la PPA se clasifica en al menos 24 genotipos distintos, basados en la secuencia del gen B646L (que codifica la proteína p72), y casi la misma cantidad de serotipos, siendo los 8 más comunes determinados por la variabilidad de la proteína CD2v (EP402R). Sin embargo, la correlación entre genotipo, serotipo y virulencia aún no se comprende bien: los virus dentro del mismo genotipo pueden tener diferentes comportamientos epidemiológicos.

Un reciente estudio filogenético, “Contribución filogenética para comprender la propagación panzoótica de la peste porcina africana: de la escala global a la local” (Rossi et al., 2025), ha contribuido decisivamente a esclarecer los mecanismos de propagación del virus a escala global y local, destacando cómo pequeños eventos evolutivos y mutaciones puntuales pueden influir en la geografía de las epidemias. Este tipo de enfoque filogenético es crucial para rastrear la historia filogeográfica del virus e interpretar sus vías de propagación.

Figura 2. Propagación global del virus de la PPA (Rossi et al. bioRxiv 2025).

Figura 2. Propagación global del virus de la PPA (Rossi et al. bioRxiv 2025).

Nuevas tecnologías, un rompecabezas por resolver

Hoy en día, las nuevas plataformas de secuenciación y las herramientas bioinformáticas avanzadas abren perspectivas sin precedentes. Las técnicas de secuenciación de lectura larga permiten leer tramos muy extensos de ADN, reduciendo los errores en regiones repetidas. Al mismo tiempo, la integración con datos proteómicos y estructurales podría ayudar a descifrar la función de muchos genes aún “huérfanos de significado”.

Sin embargo, mientras los genomas completos sigan siendo escasos y la cooperación científica internacional sea limitada, el virus de la peste porcina africana seguirá siendo, desde el punto de vista genético, un gigante envuelto en misterio.

Consulta la "guía de enfermedades" para más información

Peste porcina africanaLa peste porcina africana es una de las enfermedades víricas más importantes en cerdos. Es una enfermedad sistémica y es notificable en la mayoría de países del mundo.

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