Diagnostic de laboratoire : fièvre aphteuse

Tests disponibles:

Pathologie macroscopique :

• Identification des lésions, en particulier des vésicules sur le groin et les pattes.
• Avantages :
  • Identification macroscopique facile des vésicules.
• Inconvénients :
  • Cliniquement impossible à distinguer des autres maladies vésiculaires.
  • Nécessite souvent un diagnostic plus approfondi.

Polymerase Chain Reaction (PCR)

• Détecte la présence d'une séquence d'acide nucléique (ARN) viral spécifique.
• Types d'échantillons : liquide vésiculaire ou épithélium (type d'échantillon préféré), sérum, échantillon oesophagien-laryngé (lorsque la vésicule ou l'épithélium n'est pas disponible), lait.
• Avantages :
  • Méthode de détection de l'agent la plus sensible et la plus préférée.
  • Les échantillons peuvent souvent être regroupés pour réduire les coûts et minimiser la perte de sensibilité.
  • Peut cibler des protéines universelles pour une détection générale ou des protéines spécifiques à un sérotype pour un sérotypage.
• Inconvénients :
  • Coût modéré.
  • Nécessite des amorces appropriées, en particulier si l'on cible des protéines structurelles spécifiques à un sérotype.

Liste des sérotypes actuellement connus pour la fièvre aphteuse (pas de protection croisée entre les sérotypes) :

• Asie 1
• Afrique du Sud Type 1 (SAT 3)
• Afrique du Sud Type 1 (SAT 2)
• Afrique du Sud Type 1 (TSS 1)
• C
• A
• O

Test immuno-enzymatique de détection d'antigène (Ag-ELISA)

• Détecte la présence d'antigènes.
• Types d'échantillons : liquide vésiculaire ou épithélium (type d'échantillon préféré), sérum, échantillon oesophagien-laryngé (lorsque la vésicule ou l'épithélium n'est pas disponible), lait.
• Avantages :
  • Méthode de choix pour la détection et l'identification des sérotypes.
  • Peut être utilisée pour le diagnostic d'un seul animal ou d'une exploitation.
  • Peut être utilisée pour différencier les sérotypes.
  • Tout résultat positif pour un virus de terrain est considéré comme significatif.

Tableau 1. Différentes protéines virales peuvent être utilisées pour faciliter le diagnostic.

Antigène cible	Variabilité	Utilisation
Protéines structurelles	Variable	Sérotypage
Protéines non structurelles	Conservée	Détection universelle : non spécifique au sérotype

• Inconvénients :
  • La présence d'un antigène viral peut être spécifique du sérotype.
  • Plusieurs tests peuvent être nécessaires pour identifier les sérotypes.

Test immuno-enzymatique de détection d'anticorps (Ab-ELISA)

• Détecte la présence d'anticorps.
• Types d'échantillons : sérum.
• Avantages :
  • Les anticorps circulants peuvent être détectés 3 à 5 jours après l'apparition des signes cliniques.
  • Les animaux restent positifs pendant plusieurs mois.
  • Peut être utilisé dans les cas plus anciens.
  • Peut être utilisé pour différencier l'exposition au virus de terrain de certains vaccins tués/recombinants (ciblant des protéines non structurelles spécifiques).
  • Tout résultat positif pour le virus de terrain est considéré comme significatif.
• Inconvénients :
  • La réponse des anticorps est spécifique du sérotype.
  • Certains animaux peuvent rester séropositifs pendant plusieurs années.
  • La force de la réponse immunitaire peut varier en fonction de la virulence de la souche.
  • La présence d'anticorps n'est pas toujours synonyme de protection.

• Dispositifs à flux latéral
• Détecte la présence d'antigènes.
• Types d'échantillons : liquide vésiculaire ou épithélium.
• Avantages :
  • Méthode de choix pour la détection et l'identification des sérotypes.
  • Peut être utilisée pour le diagnostic d'un seul animal ou au niveau de l’élevage.
  • Peut être utilisée pour différencier les sérotypes.
  • Tout résultat positif pour un virus de terrain est considéré comme significatif.
• Inconvénients :
  • La présence d'antigènes viraux peut être spécifique d'un sérotype.
  • Moins sensible que l'Ag-ELISA
  • Plusieurs tests peuvent être nécessaires pour identifier les sérotypes.

• Isolement du virus
• Isole le virus vivant.
• Types d'échantillons : liquide vésiculaire ou épithélium (type de prélèvement préféré), sérum, échantillon oesophagien-laryngé (lorsque la vésicule ou l'épithélium n'est pas disponible), lait.
• Avantages :
  • Critère de référence.
  • Isolement du virus pour le développement de vaccins (autovaccins) ou tests sérologiques (ELISA) pour le sérotypage.
• Inconvénients :
  • Coûteux.
  • Résultats lents.
  • Nécessite des lignées cellulaires spéciales : cellules thyroïdiennes de bovin (veau) ou cellules rénales de porc, de veau ou d'agneau.
  • Le processus d'inoculation est très laborieux.
  • Souvent difficile à cultiver (nombreux faux négatifs).

Séquençage génétique

• Séquence des segments génétiques de l'acide nucléique (ARN) du virus.
• Types d'échantillons : liquide vésiculaire ou épithélium (type d'échantillon préféré), sérum, échantillon oesophagien-laryngé (lorsque la vésicule ou l'épithélium n'est pas disponible), lait.
• Avantages :
  • Peut être utile à l'épidémiologie moléculaire.
  • Permet d'identifier le sérotype.
• Inconvénients :
  • Coûteux.
  • Résultats lents.

Interprétation des résultats :

Lésions macroscopiques (vésicules)

• Positif : à étudier en tant que fièvre aphteuse possible.
• Négatif : Négatif ou non détecté si le test est effectué longtemps après l'infection ou si l'infection est due à une souche peu virulente.

PCR

• Positive : présence du virus.
• Négative : Négative ou le virus n'est pas détecté si le test est effectué longtemps après l'infection.

Ag-ELISA

• Positif : présence du virus.
• Négatif : Négatif, le virus n'est pas détecté si le test est effectué longtemps après l'infection ou si le mauvais sérotype a été testé.

Ab-ELISA

• Positif : anticorps maternels ou exposition antérieure (>2-3 jours) au virus de terrain ou à certains vaccins.
• Négatif : négatif ou exposition au vaccin ou au virus de terrain trop récente pour être détectée ou testé pour des anticorps de sérotype incorrect.

Dispositifs à flux latéral

• Positif : présence du virus.
• Négatif : le virus n'est pas détecté si le test est effectué longtemps après l'infection ou si le mauvais sérotype a été testé.

Isolement du virus

• Positif : le virus est présent.
• Négatif : le virus n'est pas détecté si le test est effectué longtemps après l'infection ou si la mauvaise lignée cellulaire a été utilisée.

Séquençage génétique

• Positif : le virus est présent.
• Négatif : le virus n'est pas détecté si le test est effectué trop longtemps après l'infection ou si la quantité de virus présente est trop faible pour permettre le séquençage.

Scénarios

Il est important de noter que, dans certains pays, l'approbation des autorités compétentes peut être requise avant la réalisation de tout test de dépistage de la fièvre aphteuse.

Suspicion d'un foyer aigu de fièvre aphteuse chez des porcs de tout âge, l’élevage n'étant pas vacciné contre la fièvre aphteuse.

• Prélever du liquide vésiculaire sur plusieurs animaux atteints et effectuer un test Ag-ELISA ou une PCR ; la mise en commun des échantillons (pooling) peut être envisagée pour la PCR.

Suspicion de foyer aigu de fièvre aphteuse chez des porcs de tout âge et élevage vacciné contre la fièvre aphteuse

• Prélever du liquide vésiculaire sur plusieurs animaux atteints et effectuer un test Ag-ELISA ou PCR ; la mise en commun des échantillons (pooling) peut être envisagée pour la PCR.
• Prélever le sérum de plusieurs animaux atteints qui présentent des signes cliniques depuis au moins 3 jours et effectuer un test individuel par Ab-ELISA ; la protéine non structurelle ciblée n'est pas présente dans le vaccin.

Suspicion d'une circulation de la fièvre aphteuse chez des porcs de tout âge ne présentant pas de signes cliniques et dont l'élevage n'est pas vacciné contre la fièvre aphteuse.

• Prélever du sérum sur 30 porcs échantillonnés au hasard et effectuer un test individuel par Ab-ELISA ; protéine structurelle cible.

Suspicion de circulation de la fièvre aphteuse chez des porcs de tout âge ne présentant pas de signes cliniques et dont l’élevage est vacciné contre la fièvre aphteuse.

• Prélever du sérum sur 30 porcs échantillonnés au hasard et effectuer un test individuel par Ab-ELISA ; la protéine non structurelle ciblée n'est pas présente dans le vaccin.