Cuantificación de bacterias, enterobacterias y lactobacilos totales en la digesta de cerdos mediante PCR a tiempo real
M. Castillo, S.M. Martín-Orúe, E.G. Manzanilla, I. Badiola, M. Martín and J. Gasa. Quantification of total bacteria, enterobacteria and lactobacilli populations in pig digesta by real-time PCR. Veterinary Microbiology. 2006. Vol. 114 (1-2): 165-170.
07-jun-2006 (hace 17 años 11 meses 2 días)Para evaluar la utilización de la PCR a tiempo real (qPCR) como método
para cuantificar las bacterias intestinales en cerdos, bacterias,
lactobacilos y enterobacterias totales fueron cuantificados mediante qPCR y los resultados fueron comparados con los obtenidos mediante los métodos tradicionales (4',6-diamidino-2-fenilindol (tinción DAPI) para las bacterias totales y cultivo selectivo para los lactobacilos y las enterobacterias).
Si bien los valores de la qPCR en términos de copias del gen del rRNA 16S fueron mayores que los recuentos de DAPI o CFU, el cociente lactobacilos:enterobacterias fue similar entre los métodos (2,5 ± 0,58 para qPCR y 3,1 ± 0,71 para el cultivo selectivo).
Independientemente de las diferencias numéricas observadas entre los métodos, los valores obtenidos mediante la qPCR y los métodos tradicionales mostraron una correlación significativa para los lactobacilos y las bacterias totales de forma que la qPCR se presenta como un método válido para cuantificar los cambios microbianos en el aparato gastrointestinal de los cerdos.
Si bien los valores de la qPCR en términos de copias del gen del rRNA 16S fueron mayores que los recuentos de DAPI o CFU, el cociente lactobacilos:enterobacterias fue similar entre los métodos (2,5 ± 0,58 para qPCR y 3,1 ± 0,71 para el cultivo selectivo).
Independientemente de las diferencias numéricas observadas entre los métodos, los valores obtenidos mediante la qPCR y los métodos tradicionales mostraron una correlación significativa para los lactobacilos y las bacterias totales de forma que la qPCR se presenta como un método válido para cuantificar los cambios microbianos en el aparato gastrointestinal de los cerdos.