A reavaliação dos genótipos da PSA revela a existência de apenas seis grupos distintos de p72

O vírus da peste suína africana (PSA) está atualmente a causar uma pandemia global altamente letal em suínos domésticos e javalis. Atualmente, estão disponíveis comercialmente no Vietname vacinas recombinantes vivas atenuadas baseadas numa estirpe do genótipo II do vírus. Com 25 genótipos do vírus da PSA descritos na literatura, é importante compreender a base molecular e a utilidade da genotipagem do vírus da PSA, bem como a verdadeira importância dos genótipos na epidemiologia, transmissão, evolução, controlo e prevenção do vírus da PSA. Historicamente, a genotipagem do vírus da PSA era utilizada para a monitorização epidemiológica da doença e baseava-se na análise de pequenos fragmentos que representavam menos de 1% do genoma do vírus.

Métodos: O método predominante para a determinação do genótipo do vírus da PSA baseia-se na sequenciação de um fragmento do gene que codifica a proteína estrutural p72.A genotipagem tem sido efectuada utilizando árvores filogenéticas automatizadas ou comparando a sequência-alvo com o gene p72 genotipado mais estreitamente relacionado. Para avaliar a sua adequação à genotipagem por p72, todos os dados genómicos disponíveis para o vírus da PSA foram reanalisados neste estudo.

Resultados: Concluiu-se que a maioria dos genótipos baseados no gene p72, quando inicialmente criados, não foram identificados segundo quaisquer critérios metodológicos específicos nem corretamente comparados com os genótipos existentes do vírus da PSA.

Conclusão: Com base na análise das sequências da proteína p72, propõe-se que os actuais vinte e cinco genótipos, criados exclusivamente a partir da sequência p72, sejam reduzidos a apenas seis genótipos. Para ajudar a diferenciar entre o novo e o antigo sistema de classificação de genótipos, propõe-se a utilização de algarismos árabes (1, 2, 8, 9, 15 e 23) em vez dos algarismos romanos anteriormente utilizados. Além disso, discute-se a utilidade da genotipagem de isolados de vírus da PSA com base apenas na sequência do gene p72.