Actinobacillus suis wyizolowane od chorych świń są filogenetycznie spokrewnione, ale posiadają różną liczbę kopii genu związanego z produkcją toksyn

Gram-ujemna bakteria Actinobacillus suis jest czynnikiem o globalnym znaczeniu dla przemysłu trzody chlewnej i przyczyną śmiertelnej choroby układu oddechowego lub posocznicy u świń w różnym wieku. W latach 2018-2019 siedem komercyjnych gospodarstw w zachodniej Kanadzie doświadczyło epizodów zwiększonej śmiertelności z powodu zakażenia A. suis u świń hodowlanych. Celem tej pracy było profilowanie, za pomocą metod molekularnych, A. suis wyizolowanych z chorych świń i porównanie ich z innymi izolatami. W tym badaniu obserwacyjnym wykorzystano dziewięć zachodnio-kanadyjskich szczepów uzyskanych z płuc (n = 6), serca (n = 2) i mózgu (n = 1) chorych świń i przeprowadzono sekwencjonowanie całego genomu. Przeprowadzono porównawcze analizy genomowe w celu scharakteryzowania zmienności genetycznej, oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe oraz obecnych genów wirulencji.

W porównaniu ze szczepem referencyjnym (ATCC 33415), zwiększoną liczbę kopii genu RTX (powtórzenia w toksynie strukturalnej) zidentyfikowano w szczepach wyizolowanych z narządów pozbawionych powierzchni śluzówki, a więc teoretycznie trudniejszych do inwazji. Szczepy zachodnio-kanadyjskie nie posiadały genów związanych z opornością na środki przeciwdrobnoustrojowe stosowane w produkcji trzody chlewnej. Zidentyfikowano również nowe regiony w genomach pięciu z dziewięciu szczepów, co wskazuje na rekombinację i powstawanie nowych szczepów.

Wyniki uzyskane w tym badaniu były związane z pojawieniem się nowych linii. Sugeruje się, że zwiększona liczba kopii genu toksyny RTX jest związana z większą zjadliwością. Badanie to przyczyni się do poprawy naszej wiedzy na temat A. suis i może pomóc w opracowaniu szczepionki i środków kontroli czynników.