Transkryptom wirusa afrykańskiego pomoru świń

Wirus afrykańskiego pomoru świń (ASFV) stanowi największe globalne zagrożenie dla hodowli zwierząt w historii. Pomimo jego znaczenia, niewiele wiadomo na temat mechanizmów i regulacji transkrypcji ASFV. Stosując metody sekwencjonowania RNA, ustaliliśmy całkowitą ilość RNA, miejsca rozpoczęcia transkrypcji i miejsca zakończenia transkrypcji na poziomie pojedynczego nukleotydu. To pozwoliło nam scharakteryzować motywy konsensusowe DNA wczesnych i późnych promotorów rdzenia ASFV, a także determinantę sekwencji poli-tymidylanowej do terminacji transkrypcji.

Nasze wyniki pokazują, że ASFV wykorzystuje alternatywne miejsca rozpoczęcia transkrypcji między wczesnymi i późnymi stadiami zakażenia oraz że ASFV-RNAP ulega poślizgowi transkrypcji z promotorem na prążkach na końcach 5 'jednostek transkrypcyjnych, dodając quasi szablonowe rozszerzenia AU- i AUAU-5' do mRNA .

Prezentujemy pierwsze bardzo potrzebne badanie całego transkryptomu obejmujące cały genom, które zapewnia unikalny wgląd w transkrypcję ASFV i służy jako źródło pomocy w przyszłych analizach funkcjonalnych genów ASFV, które są niezbędne do zwalczania tej wyniszczającej choroby.