T-RACING: Applicazione a supporto della ricerca epidemiologica delle malattie nella produzione animale in Italia

Candeloro, L., Savini, L., Conte, A., Calistri, P., Palma, D., Perticara, S., ... & De Massis, F. (2025). T-Racing: a modern tool for supporting epidemiological investigation in animal disease outbreaks in Italy. PloS one, 20(2), e0317313.https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313

05-Giu-2025 (10 mesi 14 giorni fa)

L'approccio One Health unisce gli sforzi tra le interfacce uomo-animale-ambiente contro minacce condivise come le malattie zoonotiche. T-Racing è un'applicazione web Shiny che supporta le indagini epidemiologiche e contribuisce a contenere la diffusione di malattie legate al bestiame, allineandosi ai principi multidisciplinari per la tutela della salute pubblica.

Materiali e Metodi: L'applicazione utilizza tecniche di analisi di rete temporale per affrontare la natura dinamica del commercio di animali, facilitando strategie di tracciamento a ritroso e in avanti. T-Racing sfrutta i servizi web per recuperare dati da più fonti simultaneamente e quasi in tempo reale tramite il pacchetto Plumber e viene distribuito tramite Shinyproxy. T-Racing gestisce e analizza set di dati estesi e diversificati all'interno dello stesso ambiente, inclusi dati sugli spostamenti degli animali, dati sulle epidemie e dati genomici, tutti ottenuti da database nazionali italiani. In questo lavoro, mostriamo le capacità di T-Racing simulando indagini epidemiologiche su epidemie di brucellosi e tubercolosi verificatesi in aree non endemiche d'Italia. Per evidenziare ulteriormente le sue capacità, è disponibile una demo interattiva di T-Racing che ne mostra il potenziale e le funzionalità.

Fig. 1. Frammentazione e aggregazione della rete nei registri di movimentazione degli animali. Il pannello in alto a destra mostra come più allevatori della stessa azienda siano rappresentati come nodi diversi, il che porta a una frammentazione artificiale. Il pannello in basso a destra illustra il processo di aggregazione, in cui ogni nodo rappresenta l'azienda fisica, che comprende più proprietari a livello fiscale. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313.g001

Risultati: Questo strumento supporta le indagini epidemiologiche adottando un approccio basato sui dati, guidando gli utenti attraverso l'analisi, attraverso un processo iterativo e sfruttando al contempo la loro competenza.

Conclusioni: Consente un'analisi dei dati più rapida, migliora la comprensione dei modelli di trasmissione delle malattie e facilita interventi tempestivi e mirati...

Figura 3. Mappa concettuale di T-Racing. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313.g003